| 順位 | タイム | 選手 | 学年 | 大学 |
| 1 | 1:05:49 | ｲｪｺﾞﾝ ｳﾞｨﾝｾﾝﾄ | 2 | 東京国際大 |
| 2 | 1:07:09 | ﾗｲﾓｲ ｳﾞｨﾝｾﾝﾄ | 3 | 国士舘大 |
| 3 | 1:07:14 | 池田 耀平 | 4 | 日本体育大 |
| 4 | 1:07:15 | 松山 和希 | 1 | 東洋大 |
| 5 | 1:07:17 | ｼﾞｮｾﾌ ﾗｼﾞﾆ | 2 | 拓殖大 |
| 6 | 1:07:18 | ﾌｨﾘｯﾌﾟ ﾑﾙﾜ | 2 | 創価大 |
| 7 | 1:07:26 | 田澤 廉 | 2 | 駒澤大 |
| 8 | 1:07:30 | 名取 燎太 | 3 | 東海大 |
| 9 | 1:07:33 | 井手 孝一 | 3 | 神奈川大 |
| 10 | 1:08:05 | 野村 優作 | 2 | 順天堂大 |
| 11 | 1:08:11 | 菊地 駿弥 | 4 | 城西大 |
| 12 | 1:08:16 | 太田 直希 | 3 | 早稲田大 |
| 12 | 1:08:16 | 星 岳 | 4 | 帝京大 |
| 14 | 1:08:29 | 中村 唯翔 | 2 | 青山学院大 |
| 15 | 1:09:14 | 中西 大翔 | 2 | 國學院大 |
| 16 | 1:09:38 | 森 凪也 | 3 | 中央大 |
| 17 | 1:09:48 | 加藤 大誠 | 2 | 明治大 |
| 18 | 1:10:19 | 森山 真伍 | 4 | 山梨学院大 |
| 19 | 1:10:39 | 河田太一平 | 2 | 法政大 |
| 20 | 1:11:30 | 茅野 雅博 | 4 | 専修大 |
| 21 | 1:11:38 | 河村 悠 亜細亜大 |
3 | 関東学連 |
【速報】箱根駅伝2021 2区区間結果
