| 順位 | タイム | 選手 | 大学 |
| 1 | 1:03:02 | 鎌田 航生 | 法政大 |
| 2 | 1:03:08 | 塩澤 稀夕 | 東海大 |
| 3 | 1:03:18 | 福田 悠一 | 創価大 |
| 4 | 1:03:19 | 呑村 大樹 | 神奈川大 |
| 5 | 1:03:19 | 井川 龍人 | 早稲田大 |
| 6 | 1:03:20 | 吉田 圭太 | 青山学院大 |
| 7 | 1:03:24 | 藤本 珠輝 | 日本体育大 |
| 8 | 1:03:24 | 砂岡 拓磨 | 城西大 |
| 9 | 1:03:26 | 児玉 悠輔 | 東洋大 |
| 10 | 1:03:28 | 難波 天 | 関東学連 [OP] |
| 11 | 1:03:33 | 三浦 龍司 | 順天堂大 |
| 12 | 1:03:34 | 合田 椋 | 拓殖大 |
| 13 | 1:03:34 | 藤木 宏太 | 國學院大 |
| 14 | 1:03:37 | 小野寺 悠 | 帝京大 |
| 15 | 1:03:47 | 丹所 健 | 東京国際大 |
| 16 | 1:03:49 | 白鳥 哲汰 | 駒澤大 |
| 17 | 1:04:08 | 児玉 真輝 | 明治大 |
| 18 | 1:04:19 | 千守 倫央 | 中央大 |
| 19 | 1:04:36 | 山本 龍神 | 国士舘大 |
| 20 | 1:05:01 | 高瀬 桂 | 専修大 |
| 21 | 1:05:06 | 新本 駿 | 山梨学院大 |
【速報】箱根駅伝2021 1区区間結果
