| 順位 | タイム | 大学 |
| 1 | 2:22:24 | 名城大 |
| 2 | 2:25:22 | 大東文化大 |
| 3 | 2:25:59 | 日本体育大 |
| 4 | 2:26:19 | 立命館大 |
| 5 | 2:26:24 | 松山大 |
| 6 | 2:26:33 | 拓殖大 |
| 7 | 2:28:09 | 城西大 |
| 8 | 2:28:15 | 全日本大選抜 |
| 9 | 2:28:21 | 大阪芸術大 |
| 10 | 2:28:55 | 大阪学院大 |
| 11 | 2:29:14 | 関西外国語大 |
| 12 | 2:29:36 | 東北福祉大 |
| 13 | 2:30:04 | 東洋大 |
| 14 | 2:30:06 | 佛教大 |
| 15 | 2:31:26 | 関西大 |
| 16 | 2:31:31 | 中京学院大 |
| 17 | 2:32:16 | 順天堂大 |
| 18 | 2:32:34 | 中央大 |
| 19 | 2:33:08 | 京都産業大 |
| 20 | 2:33:46 | 福岡大 |
| 21 | 2:34:01 | 京都光華女子大 |
| 22 | 2:35:00 | 亜細亜大 |
| 23 | 2:36:17 | 筑波大 |
| 24 | 2:39:45 | 静岡学生選抜 |
富士山女子駅伝2021 総合結果
