トップ50
| 順位 | 氏名 | 大学 | 学年 | タイム | 大会 |
| 1 | 篠原倖太朗 | 駒澤 | 2 | 1:00:11 | 2023丸亀 |
| 2 | 吉田 礼志 | 中央学院 | 2 | 1:00:31 | 2023丸亀 |
| 3 | 山野 力 | 駒澤 | 3 | 1:00:40 | 2022山口 |
| 4 | 山本 歩夢 | 國學院 | 1 | 1:00:43 | 2022山口 |
| 4 | 松山 和希 | 東洋 | 2 | 1:00:43 | 2022山口 |
| 6 | 村山 謙太 | 駒澤 | 3 | 1:00:50 | 2014丸亀 |
| 8 | 永田宏一郎 | 鹿屋体育 | 4 | 1:01:09 | 2001京都 |
| 9 | 川瀬 翔矢 | 皇学館 | 3 | 1:01:18 | 2020丸亀 |
| 10 | 神野 大地 | 青山学院 | 3 | 1:01:21 | 2015丸亀 |
| 10 | 中谷 圭佑 | 駒澤 | 3 | 1:01:21 | 2016丸亀 |
| 12 | 塩尻 和也 | 順天堂 | 4 | 1:01:22 |
2018箱根予選
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| 13 | 工藤 有生 | 駒澤 | 2 | 1:01:25 | 2016丸亀 |
| 13 | 若林 宏樹 | 青山学院 | 2 | 1:01:25 | 2023丸亀 |
| 15 | 中山 顕 | 中央 | 4 | 1:01:32 | 2018上尾 |
| 15 | 青木 祐人 | 國學院 | 4 | 1:01:32 | 2020丸亀 |
| 17 | 山本 唯翔 | 城西 | 3 | 1:01:34 | 2023丸亀 |
| 18 | 鈴木 健吾 | 神奈川 | 3 | 1:01:36 | 2017立川 |
| 18 | 池田 耀平 | 日本体育 | 3 | 1:01:36 | 2020丸亀 |
| 18 | 山川 拓馬 | 駒澤 | 1 | 1:01:36 | 2023丸亀 |
| 21 | 横手 健 | 明治 | 3 | 1:01:37 | 2015丸亀 |
| 21 | 花尾 恭輔 | 駒澤 | 2 | 1:01:37 | 2022山口 |
| 23 | 窪田 忍 | 駒澤 | 2 | 1:01:38 | 2012丸亀 |
| 24 | 井上 大仁 | 山梨学院 | 3 | 1:01:39 | 2014丸亀 |
| 25 | 岩崎 大洋 | 上武 | 3 | 1:01:40 | 2020丸亀 |
| 26 | 三浦 龍司 | 順天堂 | 1 | 1:01:41 |
2020箱根予選
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| 27 | 前田 和摩 | 東京農業 | 1 | 1:01:42 |
2023箱根予選
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| 27 | 高山 豪起 | 國學院 | 1 | 1:01:42 | 2023丸亀 |
| 29 | 猿橋 拓己 | 筑波 | 4 | 1:01:43 |
2020箱根予選
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| 30 | 設楽 啓太 | 東洋 | 2 | 1:01:45 | 2012丸亀 |
| 30 | 鈴木 塁人 | 青山学院 | 3 | 1:01:45 | 2019丸亀 |
| 30 | 相澤 晃 | 東洋 | 3 | 1:01:45 | 2019立川 |
| 30 | 菊地 駿弥 | 城西 | 4 | 1:01:45 |
2020箱根予選
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| 34 | 吉田 圭太 | 青山学院 | 2 | 1:01:46 | 2019丸亀 |
| 34 | 赤崎 暁 | 拓殖 | 4 | 1:01:46 | 2019上尾 |
| 34 | 西 研人 | 筑波 | 4 | 1:01:46 |
2020箱根予選
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| 37 | 大迫 傑 | 早稲田 | 1 | 1:01:47 | 2010上尾 |
| 37 | 吉居 大和 | 中央 | 1 | 1:01:47 |
2020箱根予選
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| 37 | 難波 天 | 麗澤 | 4 | 1:01:47 |
2020箱根予選
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| 40 | 設楽 悠太 | 東洋 | 2 | 1:01:48 |
2012NY
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| 41 | 木原真佐人 | 中央学院 | 2 | 1:01:50 | 2006上尾 |
| 41 | 片西 景 | 駒澤 | 4 | 1:01:50 |
2018箱根予選
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| 41 | 平林 清澄 | 國學院 | 1 | 1:01:50 | 2022立川 |
| 41 | 伊藤 大志 | 早稲田 | 1 | 1:01:50 | 2023丸亀 |
| 45 | 中村 大聖 | 駒澤 | 3 | 1:01:51 | 2019立川 |
| 45 | 野村 優作 | 順天堂 | 2 | 1:01:51 |
2020箱根予選
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| 45 | 円 健介 | 駒澤 | 4 | 1:01:51 | 2022上尾 |
| 48 | 伊藤 達彦 | 東京国際 | 3 | 1:01:52 | 2019立川 |
| 48 | 砂岡 拓磨 | 城西 | 3 | 1:01:52 |
2020箱根予選
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| 50 | 神林 勇太 | 青山学院 | 3 | 1:01:53 | 2020丸亀 |
