総合結果
| 順位 | 大学 | 総合タイム | タイム差 |
| 1 | 早稲田大学 | 2:05:11 | 0:00 |
| 2 | 中央大学 | 2:05:13 | 0:02 |
| 3 | 専修大学 | 2:05:33 | 0:22 |
| 4 | 京都産業大学 | 2:05:42 | 0:31 |
| 5 | 順天堂大学 | 2:06:02 | 0:51 |
| 6 | 東海大学 | 2:06:14 | 1:03 |
| 7 | 亜細亜大学 | 2:06:45 | 1:34 |
| 8 | 大東文化大学 | 2:06:54 | 1:43 |
| 9 | 日本体育大学 | 2:07:27 | 2:16 |
| 10 | 法政大学 | 2:08:50 | 3:39 |
| 11 | 中国四国学連選抜 | 2:09:06 | 3:55 |
| 12 | 東京農業大学 | 2:09:55 | 4:44 |
| 13 | 徳山大学 | 2:10:05 | 4:54 |
| 14 | 名古屋商科大学 | 2:10:37 | 5:26 |
| 15 | 福岡大学 | 2:13:11 | 8:00 |
| 16 | 東北学連選抜 | 2:13:19 | 8:08 |
| 17 | 第一工業大学 | 2:13:41 | 8:30 |
| 18 | 関西大学 | 2:13:59 | 8:48 |
| 19 | 北海道学連選抜 | 2:14:48 | 9:37 |
| 20 | 北信越学連選抜 | 2:15:05 | 9:54 |
1区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 法政大学 | 小林 哲也 | 4 | 17:22 |
| 2 | 中央大学 | 久保田瑞穂 | 2 | 17:26 |
| 3 | 専修大学 | 中原 大輔 | 4 | 17:29 |
| 4 | 東海大学 | 高橋 尚孝 | 2 | 17:29 |
| 5 | 関西大学 | 岩熊 勇治 | 4 | 17:30 |
| 6 | 日本体育大学 | 菊地 忍 | 3 | 17:31 |
| 7 | 徳山大学 | 柴田 真人 | 2 | 17:31 |
| 8 | 亜細亜大学 | 池谷 重喜 | 2 | 17:32 |
| 9 | 順天堂大学 | 室 政敬 | 2 | 17:33 |
| 10 | 名古屋商科大学 | 太田 重和 | 4 | 17:36 |
| 11 | 京都産業大学 | 片岡 繁貴 | 2 | 17:36 |
| 12 | 中国四国学連選抜 | 長尾 幸保 | 4 | 17:42 |
| 13 | 福岡大学 | 酒井真一郎 | 3 | 17:44 |
| 14 | 東京農業大学 | 本田 義治 | 4 | 17:47 |
| 15 | 早稲田大学 | 郷原 剛 | 2 | 17:49 |
| 16 | 大東文化大学 | 斎藤 剛 | 3 | 17:49 |
| 17 | 東北学連選抜 | 兜森 忠道 | 3 | 18:01 |
| 18 | 第一工業大学 | 赤城 圭介 | 3 | 18:16 |
| 19 | 北信越学連選抜 | 土井健太郎 | 3 | 18:25 |
| 20 | 北海道学連選抜 | 片山 純 | 4 | 19:05 |
2区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 亜細亜大学 | 帯刀 秀幸 | 2 | 22:03 |
| 2 | 京都産業大学 | 荒川 大作 | 4 | 22:20 |
| 3 | 日本体育大学 | 野田 道胤 | 4 | 22:31 |
| 4 | 専修大学 | 湯浅 龍雄 | 3 | 22:35 |
| 5 | 中央大学 | 石本 文人 | 2 | 22:45 |
| 6 | 大東文化大学 | 萩原 英之 | 2 | 22:46 |
| 7 | 順天堂大学 | 三代 直樹 | 2 | 22:48 |
| 8 | 中国四国学連選抜 | 城 英樹 | 3 | 22:53 |
| 9 | 東海大学 | 高塚 和利 | 2 | 23:00 |
| 10 | 法政大学 | 坪田 智夫 | 1 | 23:01 |
| 11 | 早稲田大学 | 荒川 誠 | 3 | 23:18 |
| 12 | 名古屋商科大学 | 井口 英明 | 1 | 23:30 |
| 13 | 関西大学 | 中村 直樹 | 1 | 23:32 |
| 14 | 徳山大学 | 大原 誠 | 2 | 23:35 |
| 15 | 福岡大学 | 有隅 賢吾 | 3 | 23:40 |
| 16 | 東京農業大学 | 大原 桂一 | 2 | 23:51 |
| 17 | 北海道学連選抜 | 川瀬 誠 | M1 | 24:04:00 |
| 18 | 第一工業大学 | 西田 淳一 | 4 | 24:08:00 |
| 19 | 東北学連選抜 | 土屋 幸治 | 2 | 24:21:00 |
| 20 | 北信越学連選抜 | 中城 陽平 | 3 | 24:44:00 |
3区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 大東文化大学 | 池谷 寛之 | 3 | 15:22 |
| 2 | 亜細亜大学 | 野口 憲司 | 4 | 15:23 |
| 3 | 中国四国学連選抜 | 松長 信也 | 4 | 15:25 |
| 4 | 早稲田大学 | 山崎 慎治 | 2 | 15:27 |
| 5 | 専修大学 | 福永 勝彦 | 3 | 15:29 |
| 6 | 東海大学 | 西沢 洋務 | 3 | 15:37 |
| 7 | 京都産業大学 | 広瀬 尚紀 | 4 | 15:38 |
| 8 | 順天堂大学 | 政綱 孝之 | 1 | 15:40 |
| 9 | 中央大学 | 豊田 雄樹 | 2 | 15:56 |
| 10 | 日本体育大学 | 関根 孝史 | 1 | 15:58 |
| 11 | 法政大学 | 佐藤 研司 | 1 | 15:59 |
| 12 | 名古屋商科大学 | 福井竜一郎 | 3 | 16:00 |
| 13 | 東北学連選抜 | 井上 典久 | 4 | 16:08 |
| 14 | 東京農業大学 | 島田 剛 | 1 | 16:15 |
| 15 | 関西大学 | 酒居 徹地 | 4 | 16:20 |
| 16 | 徳山大学 | 吉留 光一 | 2 | 16:29 |
| 17 | 北海道学連選抜 | 小川 英宏 | 4 | 16:31 |
| 18 | 北信越学連選抜 | 西尾 章広 | 2 | 16:52 |
| 19 | 福岡大学 | 高木 章嗣 | 4 | 17:04 |
| 20 | 第一工業大学 | 三好 拓 | 3 | 17:09 |
4区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 東海大学 | 諏訪 利成 | 2 | 15:15 |
| 2 | 大東文化大学 | 柳谷 昭二 | 3 | 15:23 |
| 3 | 早稲田大学 | 前田 泰秀 | 1 | 15:27 |
| 4 | 専修大学 | 小栗 一秀 | 4 | 15:27 |
| 5 | 京都産業大学 | 前田 衆 | 3 | 15:27 |
| 6 | 徳山大学 | 栗原 英彰 | 3 | 15:29 |
| 7 | 中央大学 | 岡田 展彦 | 1 | 15:32 |
| 8 | 日本体育大学 | 木村 友泰 | 1 | 15:35 |
| 9 | 法政大学 | 小板橋直巳 | 2 | 15:35 |
| 10 | 順天堂大学 | 吉岡 善知 | 3 | 15:36 |
| 11 | 亜細亜大学 | 押切 章宏 | 3 | 15:50 |
| 12 | 名古屋商科大学 | 山岡 毅 | 2 | 15:56 |
| 13 | 中国四国学連選抜 | 山口 真司 | 4 | 16:12 |
| 14 | 東京農業大学 | 稲垣 竜治 | 3 | 16:13 |
| 15 | 福岡大学 | 石津 政和 | 1 | 16:15 |
| 16 | 東北学連選抜 | 加藤 正彦 | 4 | 16:19 |
| 17 | 関西大学 | 佐藤 正貴 | 3 | 16:19 |
| 18 | 第一工業大学 | 大村 拓 | 4 | 16:23 |
| 19 | 北海道学連選抜 | 多田 興真 | 4 | 16:27 |
| 20 | 北信越学連選抜 | 北村 真司 | 1 | 16:35 |
5区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 早稲田大学 | 藤井 一博 | 4 | 20:22 |
| 2 | 専修大学 | 藤原 正昭 | 3 | 20:26 |
| 3 | 中央大学 | 小嶋 大輔 | 2 | 20:29 |
| 4 | 日本体育大学 | 児玉 弘幸 | 4 | 20:34 |
| 5 | 東海大学 | 関 厚志 | 3 | 20:36 |
| 6 | 京都産業大学 | 前田 貴史 | 1 | 20:38 |
| 7 | 順天堂大学 | 内山 孝之 | 4 | 20:43 |
| 8 | 亜細亜大学 | 藤井 貴紀 | 2 | 20:44 |
| 9 | 東京農業大学 | 嵐田 剛史 | 4 | 20:48 |
| 10 | 大東文化大学 | 池谷 真輝 | 4 | 20:53 |
| 11 | 中国四国学連選抜 | 松山 孝 | 3 | 21:00 |
| 12 | 徳山大学 | 嘉新幸太郎 | 2 | 21:04 |
| 13 | 名古屋商科大学 | 野手 善博 | 3 | 21:20 |
| 14 | 福岡大学 | 井手潤之介 | 2 | 21:25 |
| 15 | 法政大学 | 渡辺 俊介 | 1 | 21:30 |
| 16 | 第一工業大学 | 下森 直 | 1 | 21:34 |
| 17 | 北信越学連選抜 | 橋本 一隆 | 2 | 21:38 |
| 18 | 北海道学連選抜 | 三上 雅等 | 4 | 21:47 |
| 19 | 東北学連選抜 | 富樫 昌広 | 3 | 21:55 |
| 20 | 関西大学 | 杉沢 直樹 | 4 | 22:24 |
6区
| 順位 | 大学 | 名前 | 学年 | タイム |
| 1 | 早稲田大学 | 小林 雅幸 | 4 | 32:48:00 |
| 2 | 中央大学 | 松田 和宏 | 4 | 33:05:00 |
| 3 | 順天堂大学 | 浜野 健 | 4 | 33:42:00 |
| 4 | 京都産業大学 | 細川 道隆 | 2 | 34:03:00 |
| 5 | 専修大学 | 三瓶 智 | 4 | 34:07:00 |
| 6 | 東海大学 | 横山 景 | 4 | 34:17:00 |
| 7 | 大東文化大学 | 高橋 宏幸 | 4 | 34:41:00 |
| 8 | 東京農業大学 | 和田 光弘 | 4 | 35:01:00 |
| 9 | 亜細亜大学 | 菅野 邦彰 | 3 | 35:13:00 |
| 10 | 日本体育大学 | 青柳 友博 | 3 | 35:18:00 |
| 11 | 法政大学 | 荒井 伸次 | 3 | 35:23:00 |
| 12 | 中国四国学連選抜 | 林 拓見 | 1 | 35:54:00 |
| 13 | 徳山大学 | 阪上 直義 | 4 | 35:57:00 |
| 14 | 第一工業大学 | 谷口 英和 | 2 | 36:11:00 |
| 15 | 名古屋商科大学 | 李 祖根 | 3 | 36:15:00 |
| 16 | 東北学連選抜 | 兎沢 忠良 | 3 | 36:35:00 |
| 17 | 北信越学連選抜 | 長江 祐治 | 1 | 36:51:00 |
| 18 | 北海道学連選抜 | 三木 一 | 4 | 36:54:00 |
| 19 | 福岡大学 | 山田 吉秀 | 4 | 37:03:00 |
| 20 | 関西大学 | 小島 基広 | 3 | 37:54:00 |
