| 順位 | タイム | 名前 | 大学 |
| 1 | 0:58:33 | 伊地知 賢造 | 國學院大 |
| 2 | 0:58:54 | 四釜 峻佑 | 順天堂大 |
| 3 | 0:59:02 | 飯田 貴之 | 青山学院大 |
| 4 | 0:59:12 | 花尾 恭輔 | 駒澤大 |
| 5 | 0:59:30 | 手島 駿 | 中央大 |
| 6 | 0:59:32 | 宮下 隼人 | 東洋大 |
| 7 | 0:59:35 | 河田 太一平 | 法政大 |
| 8 | 0:59:46 | 吉本 光希 | 中央学院大 |
| 9 | 1:00:18 | 山口 賢助 | 早稲田大 |
| 10 | 1:00:19 | 松浦 崇之 | 東北大 |
| 11 | 1:00:26 | 守屋 和希 | 関西学院大 |
| 12 | 1:00:46 | 宗像 聖 | 東京国際大 |
| 13 | 1:00:53 | 細谷 翔馬 | 帝京大 |
| 14 | 1:00:59 | 竹村 拓真 | 東海大 |
| 15 | 1:01:23 | 加藤 大誠 | 明治大 |
| 16 | 1:01:36 | 桐山 剛 | 拓殖大 |
| 17 | 1:01:52 | 吉岡 龍一 | 日本学連選抜 |
| 18 | 1:02:01 | 中角 航大 | 大阪経済大 |
| 19 | 1:02:13 | 花井 秀輔 | 皇學館大 |
| 20 | 1:03:16 | 永田 一輝 | 立命館大 |
| 21 | 1:04:09 | 岡嶋 翼 | 日本体育大 |
| 22 | 1:05:02 | 宮本 蒼人 | 札幌学院大 |
| 22 | 1:05:02 | 堀田 翔紀 | 東海学連選抜 |
| 24 | 1:05:09 | 渡辺 翔哉 | 岐阜協立大 |
| 25 | 1:05:13 | 前原 匠 | 第一工科大 |
| 26 | 1:06:00 | 杉原 健吾 | 環太平洋大 |
| 27 | 1:06:47 | 吉岡 篤史 | 信州大 |