| 順位 | タイム | 名前 | 所属 |
| 1 | 0:31:24 | 鎧坂 哲哉 | 旭化成A |
| 2 | 0:31:47 | 中村 優吾 | 黒崎播磨 |
| 3 | 0:31:57 | 有村 優樹 | 旭化成B |
| 4 | 0:32:04 | 伊東 颯汰 | 実業団混成ﾁｰﾑ |
| 5 | 0:32:19 | 林田 洋翔 | 三菱重工 |
| 6 | 0:32:30 | 山口 武 | 西鉄 |
| 7 | 0:32:35 | 今井 篤弥 | ﾄﾖﾀ自動車九州 |
| 8 | 0:32:43 | 山口 晟弥 | 安川電機 |
| 9 | 0:32:49 | 吉田 亮壱 | 九電工 |
| 9 | 0:32:49 | 北村 宙夢 | 戸上電機製作所 |
| 11 | 0:33:34 | 森井 勇磨 | ひらまつ病院 |
| 12 | 0:34:23 | 新牛込崇史 | 国分自衛隊 |
| 13 | 0:34:41 | 竹下慎太郎 | 京セラ鹿児島 |
| 14 | 0:34:44 | 後藤 航大 | 大分選抜 |
| 15 | 0:35:02 | 吉田 翔 | 佐賀陸協選抜 |
| 16 | 0:35:40 | 平田 龍輝 | 旭化成延岡 |
| 17 | 0:35:59 | 末吉 祐太 | IBUSUKI.R.B |
| 18 | 0:36:28 | 外山 雅之 | 日置市役所 |
九州実業団駅伝2021 6区総合結果
