| 順位 | タイム | 名前 | 所属 |
| 1 | 0:37:06 | 小野 知大 | 旭化成A |
| 2 | 0:37:29 | 古賀 淳紫 | 安川電機 |
| 3 | 0:37:46 | 細谷 恭平 | 黒崎播磨 |
| 4 | 0:37:54 | 定方 俊樹 | 三菱重工 |
| 5 | 0:38:16 | 今井 正人 | ﾄﾖﾀ自動車九州 |
| 6 | 0:38:28 | 齋藤 椋 | 旭化成B |
| 7 | 0:38:30 | 吉田 裕晟 | 実業団混成ﾁｰﾑ |
| 8 | 0:38:39 | 岩室 天輝 | 戸上電機製作所 |
| 9 | 0:38:50 | 赤﨑 暁 | 九電工 |
| 10 | 0:38:56 | 東 森拓 | 西鉄 |
| 11 | 0:39:36 | 坂本 佳太 | ひらまつ病院 |
| 12 | 0:39:56 | 川口 竜也 | 日置市役所 |
| 13 | 0:40:28 | 中村 雄人 | 大分選抜 |
| 14 | 0:41:00 | 前田 伯 | IBUSUKI.R.B |
| 15 | 0:41:18 | 池田 智史 | 国分自衛隊 |
| 16 | 0:41:43 | 永谷 勇介 | 京セラ鹿児島 |
| 17 | 0:42:22 | 牧野 光留 | 旭化成延岡 |
| 18 | 0:43:12 | 森 太一 | 佐賀陸協選抜 |
九州実業団駅伝2021 5区総合結果
