| 順位 | 大会 | 区間順位 | 名前 | 大学 | 学年 | タイム |
| 1 | 95 | 1 | 小松 陽平 | 東海 | 3 | 1:03:49 |
| 2 | 97 | 1 | 大保 海士 | 明治 | 4 | 1:03:59 |
| 3 | 73 | 1 | 古田 哲弘 | 山梨学院 | 1 | 1:04:05 |
| 4 | 88 | 1 | 大津 顕杜 | 東洋 | 2 | 1:04:12 |
| 5 | 97 | 2 | 野口 英希 | 東洋 | 4 | 1:04:15 |
| 6 | 93 | 1 | 下田 裕太 | 青山学院 | 3 | 1:04:21 |
| 7 | 92 | 1 | 下田 裕太 | 青山学院 | 2 | 1:04:21 |
| 8 | 96 | 1 | 小松 陽平 | 東海 | 4 | 1:04:24 |
| 9 | 96 | 2 | 岩見 秀哉 | 青山学院 | 3 | 1:04:25 |
| 10 | 81 | 1 | 奥田 実 | 中央 | 2 | 1:04:26 |
| 11 | 97 | 3 | 岩見 秀哉 | 青山学院 | 4 | 1:04:29 |
| 12 | 95 | 2 | 飯田 貴之 | 青山学院 | 1 | 1:04:34 |
| 13 | 90 | 1 | 髙久 龍 | 東洋 | 3 | 1:04:35 |
| 14 | 76 | 1 | 奥田真一郎 | 順天堂 | 2 | 1:04:37 |
| 15 | 95 | 3 | 鈴木 宗孝 | 東洋 | 1 | 1:04:44 |
| 16 | 94 | 1 | 下田 裕太 | 青山学院 | 4 | 1:04:46 |
| 17 | 97 | 4 | 佃 康平 | 駒澤 | 3 | 1:04:48 |
| 18 | 82 | 1 | 杉本 芳規 | 中央学院 | 4 | 1:04:48 |
| 19 | 77 | 1 | 武井 拓麻 | 駒澤 | 4 | 1:04:48 |
| 20 | 96 | 3 | 鳥飼 悠生 | 帝京 | 3 | 1:04:50 |
| 21 | 95 | 4 | 伊勢 翔吾 | 駒澤 | 4 | 1:04:50 |
| 22 | 81 | 2 | 福井 誠 | 日本 | 2 | 1:04:50 |
| 23 | 78 | 1 | 中川 拓郎 | 順天堂 | 3 | 1:04:53 |
| 24 | 97 | 5 | 千明龍之佑 | 早稲田 | 3 | 1:04:55 |
| 25 | 84 | 1 | 深津 卓也 | 駒澤 | 2 | 1:04:57 |
| 26 | 81 | 3 | 田中 宏幸 | 法政 | 2 | 1:04:57 |
| 27 | 78 | 2 | 塩川 雄也 | 駒澤 | 1 | 1:04:57 |
| 28 | 81 | 4 | 信田 雄一 | 中央学院 | 3 | 1:04:59 |
| 29 | 97 | 6 | 鳥飼 悠生 | 帝京 | 4 | 1:05:06 |
| 30 | 97 | 7 | 三浦 拓朗 | 中央 | 3 | 1:05:08 |