| 順位 | 大会 | 区間順位 | 名前 | 大学 | 学年 | タイム |
| 1 | 96 | 1 | 嶋津 雄大 | 創価 | 2 | 1:08:40 |
| 2 | 96 | 2 | 吉野 貴大 | 帝京 | 4 | 1:08:43 |
| 3 | 83 | 1 | 松瀬 元太 | 順天堂 | 4 | 1:08:59 |
| 4 | 81 | 1 | 山田 紘之 | 日本体育 | 4 | 1:09:05 |
| 5 | 96 | 3 | 郡司 陽大 | 東海 | 4 | 1:09:08 |
| 6 | 90 | 1 | 大津 顕杜 | 東洋 | 4 | 1:09:08 |
| 7 | 97 | 1 | 石川 拓慎 | 駒澤 | 3 | 1:09:12 |
| 8 | 96 | 4 | 殿地 琢朗 | 國學院大學 | 2 | 1:09:19 |
| 9 | 87 | 1 | 山本 憲二 | 東洋 | 3 | 1:09:36 |
| 10 | 81 | 2 | 髙岡 弘 | 早稲田 | 3 | 1:09:40 |
| 11 | 88 | 1 | 齋藤 貴志 | 東洋 | 3 | 1:09:45 |
| 12 | 96 | 5 | 湯原 慶吾 | 青山学院 | 2 | 1:09:48 |
| 13 | 79 | 1 | 北浦 政史 | 駒澤 | 3 | 1:09:54 |
| 14 | 87 | 2 | 中島 賢士 | 早稲田 | 4 | 1:09:55 |
| 15 | 95 | 1 | 星 岳 | 帝京 | 2 | 1:09:57 |
| 16 | 81 | 3 | 松瀬 元太 | 順天堂 | 2 | 1:09:57 |
| 17 | 97 | 2 | 佐々木亮輔 | 神奈川 | 1 | 1:09:58 |
| 18 | 91 | 1 | 寺田 博英 | 城西 | 4 | 1:10:01 |
| 19 | 91 | 2 | 安藤 悠哉 | 青山学院 | 2 | 1:10:03 |
| 20 | 92 | 1 | 渡邉 利典 | 青山学院 | 4 | 1:10:07 |
| 21 | 91 | 3 | 兼子 侑大 | 山梨学院 | 4 | 1:10:09 |
| 22 | 95 | 2 | 鈴木 塁人 | 青山学院 | 3 | 1:10:10 |
| 23 | 95 | 3 | 郡司 陽大 | 東海 | 3 | 1:10:12 |
| 24 | 84 | 1 | 永岩 義人 | 城西 | 2 | 1:10:14 |
| 25 | 97 | 3 | 木付 琳 | 國學院大學 | 3 | 1:10:15 |
| 26 | 97 | 4 | 中倉 啓敦 | 青山学院 | 2 | 1:10:17 |
| 27 | 96 | 6 | 二井 康介 | 中央 | 4 | 1:10:18 |
| 28 | 78 | 1 | 櫻井 勇樹 | 早稲田 | 4 | 1:10:18 |
| 29 | 81 | 4 | 田村 航 | 中央 | 3 | 1:10:19 |
| 30 | 77 | 1 | 真名子 圭 | 大東文化 | 4 | 1:10:19 |