| 順位 | タイム | 名前 | 所属 |
| 1 | 0:30:37 | 市田 孝 | 旭化成A |
| 2 | 0:30:44 | 的野 遼大 | 三菱重工 |
| 3 | 0:30:47 | 土井 大輔 | 黒崎播磨 |
| 4 | 0:31:06 | 大塚 祥平 | 九電工 |
| 5 | 0:31:44 | 今西 駿介 | ﾄﾖﾀ自動車九州 |
| 6 | 0:31:48 | 梶原 有高 | ひらまつ病院 |
| 7 | 0:31:53 | 甲斐 翔太 | 西鉄 |
| 8 | 0:31:54 | 加藤 風磨 | 安川電機 |
| 9 | 0:31:58 | 小田部真也 | 実業団混成ﾁｰﾑ |
| 10 | 0:32:00 | 荻野 太成 | 旭化成B |
| 11 | 0:32:21 | 吉山 侑佑 | 戸上電機製作所 |
| 12 | 0:33:21 | 関 穂崇 | 旭化成延岡 |
| 13 | 0:33:35 | 轟木 太郎 | IBUSUKI.R.B |
| 14 | 0:33:47 | 米藏 亮 | 京セラ鹿児島 |
| 15 | 0:34:10 | 奥平 仁 | 国分自衛隊 |
| 16 | 0:34:15 | 徳永 涼人 | 日置市役所 |
| 17 | 0:34:24 | 財前 大志 | 大分選抜 |
| 18 | 0:35:18 | 三原 叶雅 | 佐賀陸協選抜 |
九州実業団駅伝2021 3区総合結果
