| 順位 | 往路 | 復路 | 総合 |
| 1 | 創価大 | 青山学院大 | 駒澤大 |
| 2 | 東洋大 | 駒澤大 | 創価大 |
| 3 | 駒澤大 | 中央大 | 東洋大 |
| 4 | 帝京大 | 早稲田大 | 青山学院大 |
| 5 | 東海大 | 創価大 | 東海大 |
| 6 | 東京国際大 | 國學院大 | 早稲田大 |
| 7 | 順天堂大 | 明治大 | 順天堂大 |
| 8 | 神奈川大 | 順天堂大 | 帝京大 |
| 9 | 國學院大 | 東洋大 | 國學院大 |
| 10 | 拓殖大 | 東海大 | 東京国際大 |
| 11 | 早稲田大 | 関東学連[OP] | 明治大 |
| 12 | 青山学院大 | 帝京大 | 中央大 |
| 13 | 城西大 | 東京国際大 | 神奈川大 |
| 14 | 明治大 | 日本体育大 | 日本体育大 |
| 15 | 日本体育大 | 神奈川大 | 拓殖大 |
| 16 | 法政大 | 城西大 | 城西大 |
| 17 | 国士舘大 | 拓殖大 | 法政大 |
| 18 | 山梨学院大 | 法政大 | 国士舘大 |
| 19 | 中央大 | 国士舘大 | 山梨学院大 |
| 20 | 関東学連 [OP] | 専修大 | 関東学連[OP] |
| 21 | 専修大 | 山梨学院大 | 専修大 |
箱根駅伝2021 往路・復路・総合結果一覧
