| 順位 | 名前 | チーム | タイム | トップ差 |
| 1 | 服部 勇馬 | トヨタ自動車 | 0:46:23 | |
| 2 | 青木 涼真 | Honda | 0:46:24 | 0:00:01 |
| 3 | 塩尻 和也 | 富士通 | 0:46:38 | 0:00:15 |
| 4 | 村山 謙太 | 旭化成 | 0:46:56 | 0:00:33 |
| 4 | 山下 一貴 | 三菱重工 | 0:46:56 | 0:00:33 |
| 6 | 辻村 公佑 | 大阪ガス | 0:47:08 | 0:00:45 |
| 6 | 藤曲 寛人 | トヨタ自動車九州 | 0:47:08 | 0:00:45 |
| 8 | 土井 大輔 | 黒崎播磨 | 0:47:10 | 0:00:47 |
| 9 | 髙久 龍 | ヤクルト | 0:47:16 | 0:00:53 |
| 10 | 黒川 翔矢 | JR東日本 | 0:47:19 | 0:00:56 |
| 11 | 山本 浩之 | コニカミノルタ | 0:47:23 | 0:01:00 |
| 12 | 中村 信一郎 | 九電工 | 0:47:27 | 0:01:04 |
| 13 | 吉岡 幸輝 | 中央発條 | 0:47:31 | 0:01:08 |
| 14 | 竹内 竜真 | 日立物流 | 0:47:34 | 0:01:11 |
| 14 | 中西 亮貴 | トーエネック | 0:47:34 | 0:01:11 |
| 16 | 大畑 和真 | 安川電機 | 0:47:37 | 0:01:14 |
| 17 | 上坂 優太 | JFEスチール | 0:47:44 | 0:01:21 |
| 18 | 内藤 圭太 | 愛知製鋼 | 0:47:45 | 0:01:22 |
| 19 | 湯澤 舜 | SGH | 0:47:54 | 0:01:31 |
| 20 | 川田 裕也 | 埼玉医科大学 | 0:47:58 | 0:01:35 |
| 21 | 渡邊 力将 | NTT西日本 | 0:48:07 | 0:01:44 |
| 22 | 橋本 崚 | GMO | 0:48:10 | 0:01:47 |
| 23 | 鈴木 卓也 | サンベルクス | 0:48:17 | 0:01:54 |
| 24 | 黒田 雄紀 | コモディイイダ | 0:48:18 | 0:01:55 |
| 25 | 二岡 康平 | 中電工 | 0:48:20 | 0:01:57 |
| 26 | 西山 凌平 | トヨタ紡織 | 0:48:21 | 0:01:58 |
| 27 | 永山 博基 | 住友電工 | 0:48:24 | 0:02:01 |
| 28 | 山田 直弘 | YKK | 0:48:27 | 0:02:04 |
| 29 | 田中 飛鳥 | ひらまつ病院 | 0:48:37 | 0:02:14 |
| 30 | 東 瑞基 | 愛三工業 | 0:48:44 | 0:02:21 |
| 31 | 寺西 雅俊 | マツダ | 0:48:53 | 0:02:30 |
| 32 | 奥谷 裕一 | 大塚製薬 | 0:49:00 | 0:02:37 |
| 33 | 兼実 省伍 | 中国電力 | 0:49:07 | 0:02:44 |
| 34 | 溝田 槙悟 | 戸上電機製作所 | 0:49:42 | 0:03:19 |
| 35 | 浅野 有紀 | 日本製鉄瀬戸内 | 0:50:10 | 0:03:47 |
| 36 | 光武 洋 | NDソフト | 0:50:12 | 0:03:49 |